Ещё один полезный плагин для Joplin - Ridgeline. Целая боковая панель ради того, на что смотришь пару раз в час, всегда казалась плохим разменом - поэтому здесь оглавление сжато в тонкую стопку полосок у края редактора: одна полоска на заголовок, чем выше уровень - тем длиннее, текущий раздел подсвечен. Навели мышь - разворачивается полное оглавление. Клик по заголовку - и вы там. Увели курсор - снова несколько тихих пикселей.
Работает и в редакторе Markdown, и в режиме просмотра, подстраивается под тему, может рисоваться поверх текста или отступить на небольшое поле - как удобнее. В заметках без заголовков не показывается вовсе.
Бесплатно и с открытым кодом: github.com/pmslava/joplin-plugin-ridgeline - ставится из поиска плагинов Joplin.